Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcl3Q6W5C0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl3Q6W5C0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms