Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr13Q6R5N8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr13Q6R5N8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr13Q6R5N8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms