Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neil2Q6R2P8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Neil2Q6R2P8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms