Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mfsd13aQ6PDE8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mfsd13aQ6PDE8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mfsd13aQ6PDE8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mfsd13aQ6PDE8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mfsd13aQ6PDE8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms