Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8Y7

Snx31, Sorting nexin-31, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx31Q6P8Y7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx31Q6P8Y7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx31Q6P8Y7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx31Q6P8Y7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx31Q6P8Y7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms