Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smchd1Q6P5D8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smchd1Q6P5D8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms