Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stmnd1Q6P3A1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stmnd1Q6P3A1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stmnd1Q6P3A1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stmnd1Q6P3A1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stmnd1Q6P3A1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stmnd1Q6P3A1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stmnd1Q6P3A1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stmnd1Q6P3A1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stmnd1Q6P3A1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms