Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Colgalt2Q6NVG7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Colgalt2Q6NVG7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms