Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr44Q6NVE8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Wdr44Q6NVE8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms