Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bfsp2Q6NVD9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bfsp2Q6NVD9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bfsp2Q6NVD9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bfsp2Q6NVD9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bfsp2Q6NVD9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bfsp2Q6NVD9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bfsp2Q6NVD9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bfsp2Q6NVD9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms