Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SphkapQ6NSW3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SphkapQ6NSW3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SphkapQ6NSW3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
SphkapQ6NSW3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms