Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retreg2Q6NS82 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retreg2Q6NS82 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms