Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pdcd11Q6NS46 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Pdcd11Q6NS46 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pdcd11Q6NS46 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pdcd11Q6NS46 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms