Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn11Q6J756 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn11Q6J756 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms