Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep78Q6IRU7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep78Q6IRU7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms