Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ablim3Q69ZX8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ablim3Q69ZX8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ablim3Q69ZX8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms