Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZC8

Gpalpp1, GPALPP motifs-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpalpp1Q69ZC8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpalpp1Q69ZC8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpalpp1Q69ZC8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpalpp1Q69ZC8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms