Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Top2bQ64511 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Top2bQ64511 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Top2bQ64511 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Top2bQ64511 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Top2bQ64511 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms