Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa17Q64016 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defa17Q64016 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa17Q64016 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa17Q64016 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa17Q64016 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa17Q64016 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa17Q64016 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms