Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha6Q62413 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha6Q62413 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha6Q62413 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha6Q62413 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha6Q62413 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha6Q62413 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epha6Q62413 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epha6Q62413 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epha6Q62413 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha6Q62413 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha6Q62413 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms