Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zpr1Q62384 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zpr1Q62384 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zpr1Q62384 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zpr1Q62384 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Zpr1Q62384 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Zpr1Q62384 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zpr1Q62384 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms