Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc92bQ5SUE3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc92bQ5SUE3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms