Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bbs12Q5SUD9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bbs12Q5SUD9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms