Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCQ5

Dph1, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph1Q5NCQ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dph1Q5NCQ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dph1Q5NCQ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dph1Q5NCQ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms