Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCI0

Urgcp, Up-regulator of cell proliferation, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrgcpQ5NCI0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UrgcpQ5NCI0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UrgcpQ5NCI0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UrgcpQ5NCI0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms