Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Trim41Q5NCC3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Trim41Q5NCC3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Trim41Q5NCC3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Trim41Q5NCC3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms