Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm3Q5F4S9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm3Q5F4S9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm3Q5F4S9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms