Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkaa1Q5EG47 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkaa1Q5EG47 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms