Protein–RNA interactions for Protein: Q58Y74

Trcg1, Taste receptor cell protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trcg1Q58Y74 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trcg1Q58Y74 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trcg1Q58Y74 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trcg1Q58Y74 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms