Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Eme2Q56A04 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Eme2Q56A04 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms