Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srrm1Q52KI8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srrm1Q52KI8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srrm1Q52KI8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms