Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otol1Q4ZJM7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otol1Q4ZJM7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms