Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srbd1Q497V5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srbd1Q497V5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srbd1Q497V5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms