Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa20Q45VN2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms