Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC051142Q3V0M8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BC051142Q3V0M8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC051142Q3V0M8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms