Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K9

Pls1, Plastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls1Q3V0K9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pls1Q3V0K9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pls1Q3V0K9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pls1Q3V0K9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms