Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Garnl3Q3V0G7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Garnl3Q3V0G7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms