Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bbof1Q3V079 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bbof1Q3V079 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bbof1Q3V079 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bbof1Q3V079 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bbof1Q3V079 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bbof1Q3V079 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bbof1Q3V079 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bbof1Q3V079 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bbof1Q3V079 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bbof1Q3V079 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bbof1Q3V079 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bbof1Q3V079 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bbof1Q3V079 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms