Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skap1Q3UUV5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skap1Q3UUV5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms