Protein–RNA interactions for Protein: Q3US96

Gm10735, Predicted gene 10735, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10735Q3US96 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10735Q3US96 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10735Q3US96 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10735Q3US96 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms