Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc33Q3ULW6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc33Q3ULW6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms