Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc34Q3UI66 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc34Q3UI66 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc34Q3UI66 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms