Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lmod2Q3UHZ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lmod2Q3UHZ5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lmod2Q3UHZ5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lmod2Q3UHZ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lmod2Q3UHZ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lmod2Q3UHZ5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lmod2Q3UHZ5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lmod2Q3UHZ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms