Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn7l3bQ3UD01 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms