Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk3Q3U3Q1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms