Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctu2Q3U308 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ctu2Q3U308 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms