Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec24aQ3U2P1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec24aQ3U2P1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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