Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYE7

Tmem136, Transmembrane protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem136Q3TYE7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem136Q3TYE7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem136Q3TYE7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem136Q3TYE7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms