Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RubcnlQ3TD16 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RubcnlQ3TD16 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms