Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4aQ3TCH7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul4aQ3TCH7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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